Sekolah Alam Indonesia adalah sekolah dengan konsep pendidikan yang berbasis pada ke-universalan alam semesta berdasarkan Al-Quran dan Hadist yang menerangkan bahwa tujuan manusia diciptakan salah satunya adalah menjadi khalifah di muka bumi.

Sekolah Alam Indonesia menggunakan metode pembelajaran spider web. Setiap mata pelajaran saling terkait satu sama lain secara terintegrasi. Dengan model seperti ini, siswa belajar mengaitkan pelajaran dengan kehidupan nyata dan belajar meliahat suatu hal atau masalah dari berbagai sudut pandang berbeda dan mampu mencari solusi terhadap permasalahan tersebut.

Di Sekolah Alam Indonesia, anak anak diberi kebebasan berekspresi, bereksperimen, bereksplorasi tanpa sekat dinding berbagai aturan yang mengekang rasa ingin tahu mereka. Anak dibebaskan dari tekanan mengejar nilai dan rangking, tetapi didorong untuk menumbuhkan tradisi ilmiah. Prestasi tidak dilihat dalam perbandingan dengan anak lain, tapi dari upaya mereka memaksimalkan potensi diri dan menjadi lebih baik.